あくまでも予想、というより妄想なんで、大きく外れるかもしれません。
シリウスが死んでしまった場合、霊体となったシリウスがシルビアの体に入り込んで、セリアンが復活。
そして、ベクターマーズに搭乗。
そうでない場合、「お兄様〜！」ということで、シルビアがベクターマーズのシリウスに抱きつく。
すると、二人の体が溶け合いセリアンが復活。
アポロニアスも復活し、オリジナルの第3のエレメントである不動指令もベクタールナの麗花とテレポートチェンジし、ここにオリジナルのエレメントが全て揃い、真アクエリオンとなる。
その状態で戦いに挑むが結局アクエリオンは負けてしまう。
そして、生命の樹への受粉（当然花粉はアクエリオン）が行われ、結実するが、それは同時に生命の樹が枯れることを意味していた。
そうなる事をトーマは知っていた（？）。
かくして、人類と堕天使族はリセット（つまり滅亡）され、果実が芽生える。
その芽とは、アポロとシルビア。
二人が新たなるアダムとイブになるというオチ。
